用超聲波清洗機清洗電路板是一種很好的方法，清洗出來的電路板光潔如新，利用超聲波的原理，將電能轉換成機械振動產生高壓氣泡，利用氣泡的暴破力清洗劑的微粒沖擊電路板。
在清洗電路板時要注意正確選用超聲波的功率，在清洗過程中不要將超聲波功率調得過大，其功率和容器體積、清洗電路板的量一般是成正比的，選用多大的超聲波要根據的清洗電路板的量而定，一般只適合于大批量的電路板，清洗電路板所用的溶劑一般均可使用，在清洗電路板時注意不要雜亂的堆放，有序的樹立于槽體內，雜亂的堆放影響清洗效果。
使用溶劑為有機溶劑、電路板專用清洗劑或環保電子超聲波清洗劑，不宜用無水乙醇（無水酒精），否則電路板會發白，俗稱白斑。

嚴禁從超聲波控制柜頂端的進風口處濺入導電液體(如水)。否則會對清洗機的線路系統造成嚴重損害。注意保持機器清潔，不使用時關掉電源。避免對機器的碰撞或劇烈震動。遠離熱源。機器應避免在潮濕的環境下存放。機器連續工作時間不得超過4小時，如連續工作時間過長：應旋轉超聲調節旋鈕至“0”位，而讓散熱風扇繼續工作，在超聲波清洗不啟動的狀態下為超聲波控制柜內持續散熱至少2分鐘。經長時間運行的清洗機，在停機前應首先將功率旋鈕調至零位，使用其風機再工作3-6分鐘后關機，以保證電源內部熱量散出。清洗液應及時沉淀、過濾或更換，以保證清洗效果。